Storyboard Pro には、様々なキーボードショートカット設定がすでに読み込まれています：
- Toon Boom Harmony : Toon Boom Harmonyに対するデフォルトのキーボードショートカットに例えるために設計されたキーボードショートカットの一式です。
- Toon Boom Storyboard（絵コンテ）: Storyboard Pro に対するデフォルトのキーボードショートカットです。Storyboard Pro ドキュメントが特定のキーボードショートカットを参照する際は、このプリセットのキーボードショートカットを参照します。
Keyboard Shortcuts（キーボードショートカット）ダイアログにてキーボードショートカットセット間を素早く切り替えることができます。自分のキーボードショートカットセットを作成することもできます。キーボードショートカットセットは、Storyboard Pro に既に読み込まれているショートカットプリセットと共に、環境設定に直接保存されます。また、XMLファイルとしてエクスポートして後でインポートしたり、他ユーザーと共有することもできます。